概念： 基因富集分析是指对于给定一组基因根据基因组注释信息（GO、KEGG）对基因进行聚类分析，即给定的基因是不是GO中的一个功能（或KEGG中的一个通路）。 基因的功能富集的目的是说明给定的基因集对哪些功能的影响有针对性的，不是随机影响的。 原理： 基因富集分析是通过研究给定的基因集在功能节点上是否过出现得到关注的基因集显著注释的功能节点。通常利用超几何分布等方法计算给定基因集在某个功能（或通路）上的P值，判断给定的基因集在功能（或通路）的基因数目超过了随机的期望，是一个小概率事件

GO和KEGG是基于不同的分类思想而储存的基因相关功能的数据库,富集分析就是一个把这些功能进行进行整合计算的算法，GO富集，就是研究基因的本质的，从三个层面，分别描述基因的分子功能（molecular function）、细胞组分（cellular component）、参与的生物过程（biological process）。如一个基因，她的分子功能可能是具有催化活性，她的细胞组分，也就是其在细胞中定位为细胞膜，参与的生物过程为蛋白质运输过程，这就是这个基因按照三种不同的分类方式进行的定义。